水肥一体化技术应用得好，不但能够节水节肥、增强水肥利用效率、进而可以降低成本，还可促使作物提高产量、农民增收。鉴于冬季气温较低，管道、阀门、水泵等设备若不悉心维系，特别容易出现生锈、毁坏，导致资源耗费和污染环境。
冬季，水肥一体化系统要特别注意养护，在排尽管道内的水后，要留意系统中各种阀门的维系。由于构造的缘故，特别是电磁阀结构较为复杂，其内部储水不容易彻底清除干净，在露天存放且没有保温措施的状况下，颇为易于造成阀门破裂的状况。
在系统排水后，应将球阀、闸阀等阀门保持在开启状态，防止局部储水破裂阀门。露天存放状态的阀门应包裹防冻材料。在受冻较为严重的区域，电磁阀若没有相对的保温措施，则有必要在管道排水结束以后将电磁阀的上阀体卸下来，并将电磁阀内部的水擦拭干净。
过滤系统养护
1、砂石过滤器：开启过滤器顶盖，砂石滤料不够要及时补充，以防止伤害过滤器的质量。若滤料上有悬浮异物，请捞起。同时在每个罐中放进一包氯球存放30分钟,启动反冲洗，每罐各反冲120秒，反冲2次, 随后打开过滤器罐顶盖和罐体底部排水阀，将水放尽。再将过滤器压放置排气状态。若过滤器金属镀层有毁坏，则立刻清锈后重新喷涂。
2、叠片过滤器：将每个叠片组清洁干净，随后将塑壳内的密封圈擦干放回。随后将膛内部积存物排出来, 随后将水放尽。再将过滤器放置排气状态。
3、假如过滤装置是全自动反冲洗过滤器，请在反清洁后彻底清理叠片(必需时必须酸洗，如甲酸、盐酸等)酸洗完用清水清洁干净，并放进原来位置。
施肥系统维护
在维系进行时关闭水泵，开启与主管道相连的注肥口和驱动注肥系统的进水口，排去压力。
1、配有塑料肥料罐的注肥泵：清洁肥料罐，打开罐盖晾干;清洁并按照相关说明拆开注肥泵，取出注肥泵驱动活塞，用润滑油润滑保养，拭干各部件后重新组装好。
2、注肥罐：仔细清洁罐中残液并晾干，取下罐体上软管，清洁后放置罐体内保存。灌季结束后，在施肥罐顶盖及手柄螺纹处涂上润滑油，以防锈蚀;若罐体表面金属镀层有毁坏，应立即除锈重新喷涂。
水泵维护
1、水泵停用后，要放尽水泵和管路内的剩水，并把外部泥土清洁干净，以防上冻后积水结冰把泵体和水管胀裂。
2、水泵的底阀、弯管等铸铁件，应当用钢丝刷把铁锈刷净，随后先涂上防锈漆后再涂上油漆，待干燥后再放进机房或贮存室通风干燥的地方保存。
3、检查滚珠轴承，如内外套磨损、旷动、滚珠磨损或表面有斑点都要更换。对不需要更换的可用汽油或煤油将轴承清洗干净，涂上黄油，重新装好。
4、检查水泵的叶轮是否有裂痕或小孔，叶轮固定螺母是否松动，如有损坏应修理或更换。若叶轮磨损太多或已打坏，一般应更换新叶轮。局部损坏可进行焊补，也可以用环氧树脂砂浆修补叶轮，修复后的叶轮一般应进行静平衡试验。检查叶轮减磨环处间隙，如超过规定值，应修理或更换。
5、对弯曲或磨损严重的泵轴，应当修复或更换，否则会引起转子的不平衡和有关部件的磨损。
6、卸下来的螺丝浸泡在柴油里用钢丝刷刷洗干净，并涂上机油或黄油，重新安装起来或者用塑料布包好后放好(也可浸在柴油中保存)，以免锈蚀或丢失。
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